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连云港市2023年食源性疾病中致泻性大肠埃希菌检出情况及耐药分析
Detection and drug resistance in Diarrheagenic Escherichia coli from patients with foodborne diseases in Lianyungang City in 2023
目的 了解2023年连云港市食源性疾病患者样本中分离出的致泻大肠埃希菌(DEC)的病原学特征、基因型别和耐药特征,为预防控制DEC和指导临床合理用药提供依据。方法 收集2023年连云港市3家哨点监测医院483例食源性疾病患者的粪便或肛拭子样本进行DEC分离培养,采用实时荧光定量PCR进行毒力基因分型,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行聚类分析,微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果 共分离DEC 44株,检出率为9.11%,其中EAEC 26株(占59.09%)、EPEC 10株(占22.73%)、EIEC 5株(占11.36%)、EHEC 3株(占6.82%)。26株EAEC中,11株携带antA+pic毒力基因,占42.31%。PFGE结果显示,44株DEC菌株分为41个带型,种内相似度为51%~100%。药物敏感性结果显示,44株DEC菌株中,43株耐药株,耐药率为97.73%;其中四环素耐药率最高,为88.64%(39/44),多重耐药(MDR)率为93.18%(41/44),共33种MDR药谱。结论 连云港市食源性DEC以EAEC和EPEC为主,PFGE条带呈现分散多样性,耐药情况严重。
Objective To explore the pathogenic characteristics,genotypes,and drug-resistance patterns of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) isolated from the samples of patients with foodborne diseases in Lianyungang City in 2023,and provide a reference for preventing and controlling DEC and guiding rational drug use. Methods DEC isolation and culture were performed on fecal or anal swab samples from 483 patients with foodborne diseases in three sentinel hospitals in Lianyungang City in 2023.Real-time fluorescence quantitative PCR was used to genotype virulence-associated genes,pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) was used for cluster analysis,and the micro-broth dilution method was used for drug sensitivity tests. Results A total of 44 DEC strains,with a detection rate of 9.11%,comprising 26 EAEC strains (59.09%),10 EPEC strains (22.73%),5 EIEC strains (11.36%),3 EHEC strains (6.82%),were isolated.Among the 26 EAEC strains,11 strains (42.31%) carried the antA+pic virulence gene.PFGE showed that 44 DEC strains were divided into 41 banding patterns,with intraspecific similarity ranging from 51% to 100%.Additionally,drug sensitivity tests showed that among the 44 DEC strains,43 strains were drug-resistant,with a drug resistance rate of 97.73%.The least effective drug was tetracycline,with a drug resistance rate of 88.64% (39/44),and multidrug resistance (MDR) rate was 93.18% (41/44),with a total of 33 MDR spectra. Conclusion Foodborne DEC in Lianyungang City is mainly composed of EAEC and EPEC,exhibiting dispersed and diverse banding patterns on PFGE,indicating severe drug resistance.
DEC / Virulence gene detection / Molecular typing / Drug sensitivity test
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目前可用于细菌分子分型的方法较多,脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术以其重复性好、分辨力强的优势被作为细菌分子分型的“金标准”广泛应用;利用PFGE技术对细菌进行分型并分析细菌间分型结果的差异,可以有效地对疾病进行监测,追溯疾病的感染来源,明确感染途径,追溯其遗传特征,为细菌性疾病的预防与控制提供分子生物学证据.
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目的 对2017-2020年济南市哨点医院腹泻患者中分离到的沙门氏菌进行病原学分析,了解济南市腹泻患者沙门氏菌的血清型分布特征、分子分型特征及耐药情况。方法 分别利用血清检测试剂盒和脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对来自济南市各医院腹泻门诊病人的的90株沙门氏菌进行血清分型和分子分型分析,酶切电泳图谱导入BioNumerics软件进行聚类分析;利用微量肉汤稀释法对40株沙门氏菌进行耐药性检测。结果 90株沙门氏菌可分为27个血清型,鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌为优势血清型,分别占总数的47.78%和17.78%。PFGE电泳后产生的带型具有多态性,以鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌的带型最为集中;药敏结果显示,沙门氏菌对氨苄西林耐药率最高,为72.50%,多重耐药率达67.50%。结论 济南地区沙门氏菌具有血清型多样化和遗传多样性特征,对抗生素的高耐药和多重耐药现象严重,应加强济南地区耐药检测。
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目的 了解山西省食源性疾病主动监测中沙门氏菌的药物敏感性,并对耐喹诺酮类药物的沙门氏菌进行了耐药基因与分子分型研究,为沙门氏菌临床治疗提供科学依据并初步了解沙门氏菌的耐药机制。方法 对 2014-2017年山西省食源性疾病主动监测病例中分离到的沙门氏菌进行血清学分型、药物敏感性试验以及对耐喹诺酮类药物的沙门氏菌进行耐药基因检测及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 137株沙门氏菌经诊断血清凝集后共分为16个血清型,主要为肠炎沙门氏菌51株、鼠伤寒沙门氏菌47株、其他沙门氏菌39株。 137株沙门氏菌对萘啶酸的耐药率最高,为56.93%;其次为四环素,耐药率为34.31%;对头孢噻肟、庆大霉素及头孢西丁的耐药率较低,分别为8.03%、5.84%及0.73%。对萘啶酸耐药的78株沙门氏菌,进行gyrA基因和parC基因点突变的测定,发现对萘啶酸耐药的沙门氏菌gyrA基因与parC基因检出点突变129个。51株肠炎沙门氏菌的相似度在70.6%~100%, 21株鼠伤寒沙门氏菌的相似度在58.9%~100%。结论 山西省沙门氏菌以肠炎沙门氏菌与鼠伤寒沙门氏菌为主。本地区沙门氏菌萘啶酸耐药情况最为严重,需要加强对沙门氏菌耐药的监测及喹诺酮类药物耐药机制的研究。
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目的分析广东省第二人民医院2012-2014年临床常见沙门菌耐药特性及分子分型特征。方法对分离的84株沙门菌进行血清分型、药物敏感试验。选取不同菌株来源、血清型和耐药谱的51株沙门菌,按照美国PulseNet标准进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。应用BioNumerics软件对电泳图谱进行分析,确定菌株间的相关性。结果84株菌分为20种血清型,沙门菌前3位血清型构成比从高到低分别为:鼠伤寒沙门菌占42.86%(36/84)、肠炎沙门菌占15.48%(13/84)、斯坦利沙门菌占8.33%(7/84)。本次分离沙门菌对头孢类抗生素敏感率达84.21%以上,对于环丙沙星与氯霉素的敏感性在66.67%以上,对于甲氧苄啶与庆大霉素的敏感性在50.88%以上,但仍存在多株多重耐药现象。51株沙门菌经过聚类分析可分为 42个PFGE型,表现为较大的遗传多样性。结论临床治疗时,应根据药敏试验结果指导临床,合理使用抗生素,以提高治疗效果。沙门菌耐药谱与 PFGE分型无明显关联。
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